El desarrollo académico investigativo de la Maestría se fortalece con los convenios con universidades nacionales, internaciones e instituciones de salud de Santander, que contribuyen al desarrollo investigativo de la región y del país. Cabe destacar dentro de estas, el Centro de Investigaciones, Desarrollo e Innovación Tecnológica de la FOSCAL y el Banco Multitejidos y Centro de Terapias Avanzadas de la Clínica FOSCAL Internacional, conformado por un grupo de investigadores con experiencia en enfermedades metabólicas, en banco de tejidos, medicina regenerativa y la terapia celular.
Otra fortaleza es la alianza interinstitucional conformada por las facultades de Odontología de las universidades de Antioquia, de Chile, Santo Tomás, Nacional de Colombia y del Valle. Esta alianza tiene como objetivo apoyar el desarrollo investigativo y académico en los programas de maestría y doctorado de estas universidades, para permitir el intercambio de los estudiantes, de los académicos, aprovechar los recursos docentes, y poner a disposición los diferentes laboratorios y equipos propios de cada institución, fortaleciendo así la capacidad científica e investigativa de los programas.