Los estudiantes de la Maestría podrán realizar investigaciones desde las diferentes perspectivas como alternativa para responder a las necesidades que en el campo biológico, asistencial o social registra la profesión, apoyados en las líneas de los grupos de investigación de la Facultad y de las instituciones vinculadas a través de convenios nacionales e internacionales.
Los grupos de investigación de la Facultad de Odontología, son: Salud Integral Bucal (SIB) y Sistema Estomatognático y Morfofisiología (SEMF), categorizados en A, según la convocatoria 737 de 2015.